Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
TOPBP1Q92547 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOPBP1Q92547 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms