Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf54Q8WWF1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf54Q8WWF1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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