Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC12Q8WUD4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms