Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDI1Q8WTU0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms