Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3LQ8TDB6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3LQ8TDB6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms