Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBA3Q8TBC4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBA3Q8TBC4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms