Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC4Q8TBB5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC4Q8TBB5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms