Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL22A1Q8NFW1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL22A1Q8NFW1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL22A1Q8NFW1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL22A1Q8NFW1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COL22A1Q8NFW1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL22A1Q8NFW1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL22A1Q8NFW1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL22A1Q8NFW1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL22A1Q8NFW1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL22A1Q8NFW1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL22A1Q8NFW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms