Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BEST2Q8NFU1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms