Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LINC00116Q8NCU8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00116Q8NCU8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms