Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT27Q7Z3Y8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT27Q7Z3Y8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT27Q7Z3Y8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms