Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTF1AQ7RTS3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTF1AQ7RTS3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms