Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
PREX2Q70Z35 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PREX2Q70Z35 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms