Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A10Q6U841 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms