Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC27A1Q6PCB7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A1Q6PCB7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms