Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SWSAP1Q6NVH7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms