Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD7BQ6GQQ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTUD7BQ6GQQ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD7BQ6GQQ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD7BQ6GQQ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD7BQ6GQQ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD7BQ6GQQ9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD7BQ6GQQ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD7BQ6GQQ9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD7BQ6GQQ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUD7BQ6GQQ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms