Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG16L1Q676U5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms