Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CHIC1Q5VXU3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CHIC1Q5VXU3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms