Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LRRC38Q5VT99 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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LRRC38Q5VT99 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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LRRC38Q5VT99 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC38Q5VT99 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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