Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf60Q5U649 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf60Q5U649 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C12orf60Q5U649 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf60Q5U649 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C12orf60Q5U649 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms