Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRAPPC3LQ5T215 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC3LQ5T215 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3LQ5T215 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms