Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFHC1Q5JVL4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFHC1Q5JVL4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms