Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS54

PSMG4, Proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4Q5JS54 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMG4Q5JS54 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms