Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL22Q53GT1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL22Q53GT1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms