Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SBK1Q52WX2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms