Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL40Q2TBA0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL40Q2TBA0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL40Q2TBA0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms