Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPEL1Q2QD12 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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