Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM71Q2Q1W2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM71Q2Q1W2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms