Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SWI5Q1ZZU3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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