Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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