Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSX2Q16385 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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SSX2Q16385 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SSX2Q16385 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SSX2Q16385 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SSX2Q16385 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SSX2Q16385 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SSX2Q16385 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SSX2Q16385 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSX2Q16385 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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