Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB3GAP1Q15042 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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