Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC1AQ14683 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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