Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF235Q14590 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF235Q14590 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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