Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPARCL1Q14515 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPARCL1Q14515 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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