Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
COL9A2Q14055 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COL9A2Q14055 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms