Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNTB1Q13884 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms