Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NEUROD1Q13562 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEUROD1Q13562 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
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