Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC1Q13547 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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