Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLAMF1Q13291 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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