Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
GRIN2BQ13224 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
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