Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1H3Q13133 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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