Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPP2Q13103 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPP2Q13103 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms