Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BPTFQ12830 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms