Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 PPT2YPL148C 522 nt2.85□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 MED8YBR193C 672 nt2.85□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 YHR080CYHR080C 4038 nt2.85□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 FKH2YNL068C 2589 nt2.85□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 GCD2YGR083C 1956 nt2.85□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 DBP7YKR024C 2229 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 DYN1YKR054C 12279 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 MIP6YHR015W 1980 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 WHI3YNL197C 1986 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 YDR491CYDR491C 492 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 RPL30YGL030W 318 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 BRR6YGL247W 594 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 SVP26YHR181W 687 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 SUI2YJR007W 915 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 YMR087WYMR087W 855 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 RPA43YOR340C 981 nt2.84□□□□□ -1.95
HMS1Q12398 KRE2YDR483W 1329 nt2.84□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YPR1YDR368W 939 nt2.83□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 MFA1YDR461W 111 nt2.83□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 IME1YJR094C 1083 nt2.83□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.83□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 DIM1YPL266W 957 nt2.83□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 VPS9YML097C 1356 nt2.83□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 NOP4YPL043W 2058 nt2.83□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 STE6YKL209C 3873 nt2.83□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 RAX2YLR084C 3663 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 DPP1YDR284C 870 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 THO1YER063W 657 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YFL015CYFL015C 495 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 MPS2YGL075C 1164 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 RSM27YGR215W 333 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 IPP1YBR011C 864 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 GRX5YPL059W 453 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 APD1YBR151W 951 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 BNA4YBL098W 1383 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 ARP4YJL081C 1470 nt2.82□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 XRN1YGL173C 4587 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 OAF3YKR064W 2592 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 ARO1YDR127W 4767 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 CLB3YDL155W 1284 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 DTD1YDL219W 453 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YDR090CYDR090C 933 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 GRX2YDR513W 432 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YGL230CYGL230C 444 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 IKI1YHR187W 930 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 SMD2YLR275W 333 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 NNT1YLR285W 786 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 MCA1YOR197W 1299 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 SRL1YOR247W 633 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 POL30YBR088C 777 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 snR24snR24 89 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 UTP5YDR398W 1932 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 DNM1YLL001W 2274 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 SPO14YKR031C 5052 nt2.81□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 SLH1YGR271W 5904 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 PHO81YGR233C 3537 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 EBS1YDR206W 2655 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 RIF1YBR275C 5751 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 ITT1YML068W 1395 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 PCI8YIL071C 1335 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 HTA1YDR225W 399 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 NKP1YDR383C 717 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 MAM1YER106W 909 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 GTR2YGR163W 1026 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 CPR7YJR032W 1182 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 DGA1YOR245C 1257 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 CUP9YPL177C 921 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YPR203WYPR203W 309 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 INP52YNL106C 3552 nt2.8□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 CBP2YHL038C 1893 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 ARG2YJL071W 1725 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 MRS2YOR334W 1413 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 ARF1YDL192W 546 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YGL214WYGL214W 486 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 RPS23AYGR118W 438 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 MTM1YGR257C 1101 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YGR283CYGR283C 1026 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 NNF1YJR112W 606 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 MIC27YNL100W 705 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 snR11snR11 258 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 TUM1YOR251C 915 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 CIN2YPL241C 807 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 RPS23BYPR132W 438 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 snR42snR42 351 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 PUF6YDR496C 1971 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 VIP1YLR410W 3441 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 MOT1YPL082C 5604 nt2.79□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 CCM1YGR150C 2595 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 CDC40YDR364C 1368 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 YJL049WYJL049W 1353 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 ATP16YDL004W 483 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 ERP3YDL018C 678 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 AI3Q0060 1248 nt2.78□□□□□ -1.96
HMS1Q12398 TVP15YDR100W 432 nt2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms