Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 RPS1AYLR441C 768 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 HSC82YMR186W 2118 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 RRD2YPL152W 1077 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 ISA2YPR067W 558 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 AFI1YOR129C 2682 nt2.1□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 CNA1YLR433C 1662 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 TAE2YPL009C 3117 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 MGR3YMR115W 1506 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SCL1YGL011C 759 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 TAM41YGR046W 1158 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 RRF1YHR038W 693 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 PCL7YIL050W 858 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SWP1YMR149W 861 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YMR310CYMR310C 954 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 YNL143CYNL143C 393 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 PFY1YOR122C 381 nt2.09□□□□□ -2.07
RTR2Q12378 SCD5YOR329C 2619 nt2.09□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 UBP2YOR124C 3819 nt2.09□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 SEC16YPL085W 6588 nt2.09□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YIR014WYIR014W 729 nt2.08□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 ASG7YJL170C 630 nt2.08□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YLL037WYLL037W 381 nt2.08□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 RMP1YLR145W 606 nt2.08□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 RNY1YPL123C 1305 nt2.08□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 ELG1YOR144C 2376 nt2.08□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 NOP14YDL148C 2433 nt2.08□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 VTC3YPL019C 2508 nt2.08□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 PDR11YIL013C 4236 nt2.07□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 MCM21YDR318W 1107 nt2.07□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 TIF35YDR429C 825 nt2.07□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 TIM9YEL020W-A 264 nt2.07□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 PEA2YER149C 1263 nt2.07□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 SNO1YMR095C 675 nt2.07□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YOR050CYOR050C 348 nt2.07□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 SGT1YOR057W 1188 nt2.07□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 OSW7YFR039C 1533 nt2.07□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 EDS1YBR033W 2760 nt2.06□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 VIP1YLR410W 3441 nt2.06□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 MED2YDL005C 1296 nt2.06□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YBL081WYBL081W 1107 nt2.06□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YOR082CYOR082C 342 nt2.06□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 KAR4YCL055W 1008 nt2.06□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 SWA2YDR320C 2007 nt2.06□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YDR061WYDR061W 1620 nt2.06□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 DOS2YDR068W 933 nt2.05□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 THO1YER063W 657 nt2.05□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 SKI8YGL213C 1194 nt2.05□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.05□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 PAU14YIL176C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 PAU1YJL223C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 DAD2YKR083C 402 nt2.05□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YPL071CYPL071C 471 nt2.05□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 SHG1YBR258C 429 nt2.05□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YGL262WYGL262W 528 nt2.04□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 TIM21YGR033C 720 nt2.04□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 MIP6YHR015W 1980 nt2.04□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 PSY1YKL076C 384 nt2.04□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YNL203CYNL203C 612 nt2.04□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 HUB1YNR032C-A 222 nt2.04□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YOL057WYOL057W 2136 nt2.04□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 COA2YPL189C-A 207 nt2.04□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YPR148CYPR148C 1308 nt2.04□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YRR1YOR162C 2433 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 AVT2YEL064C 1443 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YIG1YPL201C 1386 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 PHO91YNR013C 2685 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YCL068CYCL068C 783 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 RSM24YDR175C 960 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YNL046WYNL046W 519 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 END3YNL084C 1050 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 YOL107WYOL107W 1029 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 RFC5YBR087W 1065 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 CWH41YGL027C 2502 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 SCH9YHR205W 2475 nt2.03□□□□□ -2.08
RTR2Q12378 COS111YBR203W 2775 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 GRX2YDR513W 432 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 YGR291CYGR291C 222 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 YKR047WYKR047W 306 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 CCW14YLR390W-A 717 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 ERD2YBL040C 660 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 DGR1YNL130C-A 147 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 NEL1YHR035W 1893 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 SLN1YIL147C 3663 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 DUG2YBR281C 2637 nt2.02□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 MNT3YIL014W 1893 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 YBT1YLL048C 4986 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 TFC3YAL001C 3483 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 GET1YGL020C 708 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 PTI1YGR156W 1278 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 TCD1YHR003C 1290 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 MRPL49YJL096W 486 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 RPS31YLR167W 459 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 TRM112YNR046W 408 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 TSR4YOL022C 1227 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 SCP160YJL080C 3669 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 SCY1YGL083W 2415 nt2.01□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 YKL100CYKL100C 1764 nt2□□□□□ -2.09
RTR2Q12378 FIR1YER032W 2631 nt2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms