Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 MSD1YPL104W 1977 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 TFC1YBR123C 1950 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 BTN2YGR142W 1233 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 YJL032WYJL032W 315 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 ERG20YJL167W 1059 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 YPT6YLR262C 648 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 YMR141CYMR141C 309 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 YBR137WYBR137W 540 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 ARL1YBR164C 552 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 POL4YCR014C 1749 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 YNL011CYNL011C 1335 nt3.09□□□□□ -1.91
VAM3Q12241 SSL1YLR005W 1386 nt3.09□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MSR1YHR091C 1932 nt3.09□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 SYO1YDL063C 1863 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 RCY1YJL204C 2523 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 FAP7YDL166C 594 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MRPL9YGR220C 810 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 GOS1YHL031C 672 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 RPL15AYLR029C 615 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YLR050CYLR050C 486 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 NDL1YLR254C 570 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YSF3YNL138W-A 258 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MER1YNL210W 813 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 RTT109YLL002W 1311 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 IOC3YFR013W 2364 nt3.08□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 HFM1YGL251C 3564 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YAT2YER024W 2772 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MSH2YOL090W 2895 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 IES6YEL044W 501 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 RPS8BYER102W 603 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YFL015CYFL015C 495 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 LST7YGR057C 729 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 DAL2YIR029W 1032 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 ATG10YLL042C 504 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 RPS8AYBL072C 603 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 GCY1YOR120W 939 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 PFY1YOR122C 381 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 SAS5YOR213C 747 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YOR387CYOR387C 621 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 snR35snR35 204 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MED8YBR193C 672 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YBR287WYBR287W 1284 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 RRN6YBL014C 2685 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 TCP1YDR212W 1680 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MUS81YDR386W 1899 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 TPO5YKL174C 1857 nt3.07□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 HBT1YDL223C 3141 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 SMC3YJL074C 3693 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 snR83snR83 306 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 RTT105YER104W 627 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 SDP1YIL113W 630 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 COX19YLL018C-A 297 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 URA5YML106W 681 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 ARP5YNL059C 2268 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 AVT5YBL089W 1380 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 PEX27YOR193W 1131 nt3.06□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 BCH1YMR237W 2175 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 GLC3YEL011W 2115 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 PEX5YDR244W 1839 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 STP2YHR006W 1626 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 VPS38YLR360W 1320 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YDR271CYDR271C 372 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 SPT3YDR392W 1014 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 VAB2YEL005C 849 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 STE2YFL026W 1296 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 RPS0AYGR214W 759 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 VMA10YHR039C-A 345 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 AIM25YJR100C 984 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YKL115CYKL115C 393 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YKR011CYKR011C 1062 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 OST6YML019W 999 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YBR053CYBR053C 1077 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 snR24snR24 89 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 GYL1YMR192W 2163 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YCG1YDR325W 3108 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 LCB4YOR171C 1875 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 MYO5YMR109W 3660 nt3.05□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 AUS1YOR011W 4185 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 NOP56YLR197W 1515 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 VAC14YLR386W 2643 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 SPT10YJL127C 1923 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 AAD3YCR107W 1092 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 PET54YGR222W 882 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YHR212CYHR212C 336 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 PIR1YKL164C 1026 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YLR217WYLR217W 324 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 YAR060CYAR060C 336 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 SME1YOR159C 285 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 ATP20YPR020W 348 nt3.04□□□□□ -1.92
VAM3Q12241 CMD1YBR109C 444 nt3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms