Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 YMR178WYMR178W 825 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 RPL20AYMR242C 519 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 SSP2YOR242C 1116 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 RPA43YOR340C 981 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 ATG5YPL149W 885 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 SWD3YBR175W 948 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YCL019WYCL019W 5313 nt2.64□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 VPS30YPL120W 1674 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 BNR1YIL159W 4128 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YDL241WYDL241W 372 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 RNH202YDR279W 1053 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YGL152CYGL152C 678 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 MRPL38YKL170W 417 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 DAD2YKR083C 402 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 INP1YMR204C 1263 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 MCT1YOR221C 1083 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 SKO1YNL167C 1944 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 ILS1YBL076C 3219 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 SIN3YOL004W 4611 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 VHR2YER064C 1518 nt2.63□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 UTP14YML093W 2700 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 RGC1YPR115W 3252 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 HYP2YEL034W 474 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 RGI2YIL057C 495 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 MPD2YOL088C 834 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 LDH1YBR204C 1128 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 APC5YOR249C 2058 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 CWC22YGR278W 1734 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 PEX6YNL329C 3093 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 CWH41YGL027C 2502 nt2.62□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 ICR1ICR1 3199 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YOR296WYOR296W 3870 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 MLH1YMR167W 2310 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YGL118CYGL118C 438 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 MRPL9YGR220C 810 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 RPL17BYJL177W 555 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 RUF20RUF20 443 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YNL043CYNL043C 321 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 ATG34YOL083W 1239 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 POS5YPL188W 1245 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 ARO4YBR249C 1113 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 RRP14YKL082C 1305 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 RGR1YLR071C 3249 nt2.61□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YDR239CYDR239C 2364 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 BSC1YDL037C 987 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 PEF1YGR058W 1008 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 LSM8YJR022W 330 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 PIR1YKL164C 1026 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 TFA2YKR062W 987 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 NNT1YLR285W 786 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 VMA6YLR447C 1038 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 EAF7YNL136W 1278 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 INO4YOL108C 456 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 MAK5YBR142W 2322 nt2.6□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 IKI3YLR384C 4050 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YER138CYER138C 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YER160CYER160C 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YJR027WYJR027W 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YML039WYML039W 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YML045WYML045W 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YMR050CYMR050C 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 ATP22YDR350C 2055 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 UTP15YMR093W 1542 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 HBT1YDL223C 3141 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 OPI6YDL096C 327 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 BET5YML077W 480 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 MRPL16YBL038W 699 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 MIC27YNL100W 705 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 MPP6YNR024W 561 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YOL114CYOL114C 609 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 YPR050CYPR050C 414 nt2.59□□□□□ -1.99
MSH5Q12175 AVT5YBL089W 1380 nt2.59□□□□□ -2
MSH5Q12175 GEA1YJR031C 4227 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 LRG1YDL240W 3054 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 HFD1YMR110C 1599 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 SPF1YEL031W 3648 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 RMD5YDR255C 1266 nt2.58□□□□□ -2
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