Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CGNL1Q0VF96 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms